RNA id: TCONS_00051739


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051739
length 395
RNA type mRNA
GC content 0.42
exon number 2
gene id XLOC_026557
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 34084861 ~ 34085336 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCTTCTGATTGGATCAGGATCATTTACATGAGCAGCTTCAAGATGAAGAATGCCCTCTGCTTACTGCTGCTCTCATTCAGTTTACAGCGTATAAAATGTCAAAGTATGGAGTCGATTGAAAGCTCAGTTCAGAGAAAGCTTGGAGAAACTCTGACTCTATCATGTAGAGGATCGGGGTTCAGCTTTAGCTACTATAACATGCACTGGATCAGACAACAAGCTGGAAAACCTCTTGTGTGGATTGGACGTGTTTATGACAGCACTGACTATAGCTATGCTGAATCCTTCAAAAGTAGAGCTGAAATCACCCGAGATAATTCAAAGAGTATGACTTATCTGAAACTATCAGGCCTGACAGCAGAAGATTCAGCCGTGTATTACTGCGCAAGACAAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000151499

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051677 lncRNA downstream 146040 33936453 ~ 33938821 (-) True XLOC_026512
TCONS_00051675 lncRNA downstream 149423 33922620 ~ 33935438 (-) False XLOC_026512
TCONS_00053065 lncRNA downstream 165666 33918566 ~ 33919195 (-) True XLOC_026511
TCONS_00051667 lncRNA downstream 394107 33681518 ~ 33690754 (-) True XLOC_026509
TCONS_00051659 lncRNA downstream 647129 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00053066 lncRNA upstream 54301 34139637 ~ 34141181 (-) True XLOC_026572
TCONS_00051762 lncRNA upstream 94471 34179807 ~ 34180432 (-) False XLOC_026573
TCONS_00051763 lncRNA upstream 94471 34179807 ~ 34180451 (-) True XLOC_026573
TCONS_00051771 lncRNA upstream 384818 34470154 ~ 34477363 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051773 lncRNA upstream 440606 34525942 ~ 34546406 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051737 mRNA downstream 474 34081851 ~ 34084387 (-) False XLOC_026556
TCONS_00051738 mRNA downstream 2578 34081859 ~ 34082283 (-) True XLOC_026556
TCONS_00051736 mRNA downstream 3838 34080570 ~ 34081023 (-) True XLOC_026555
TCONS_00051732 mRNA downstream 6682 34074278 ~ 34078179 (-) False XLOC_026553
TCONS_00051735 mRNA downstream 8054 34076378 ~ 34076807 (-) True XLOC_026554
TCONS_00051741 mRNA upstream 1612 34086948 ~ 34087394 (-) True XLOC_026559
TCONS_00051742 mRNA upstream 3516 34088852 ~ 34089310 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051743 mRNA upstream 4647 34089983 ~ 34090456 (-) True XLOC_026560
TCONS_00051744 mRNA upstream 5964 34091300 ~ 34091356 (-) True XLOC_026561
TCONS_00051745 mRNA upstream 7122 34092458 ~ 34092914 (-) True XLOC_026562
TCONS_00051725 other downstream 19925 34063955 ~ 34064936 (-) True XLOC_026547
TCONS_00051722 other downstream 26144 34058679 ~ 34058717 (-) True XLOC_026544
TCONS_00051716 other downstream 36208 34048205 ~ 34048653 (-) True XLOC_026539
TCONS_00051715 other downstream 37245 34047179 ~ 34047616 (-) True XLOC_026538
TCONS_00051712 other downstream 46980 34037481 ~ 34037881 (-) True XLOC_026535
TCONS_00051740 other upstream 705 34086041 ~ 34086483 (-) True XLOC_026558
TCONS_00051752 other upstream 17621 34102957 ~ 34103365 (-) True XLOC_026563
TCONS_00051772 other upstream 440606 34525942 ~ 34546399 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051781 other upstream 566974 34652310 ~ 34656737 (-) False XLOC_026581
TCONS_00051782 other upstream 567636 34652972 ~ 34654998 (-) False XLOC_026581

Expression Profile

//