RNA id: TCONS_00051744


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051744
length 57
RNA type mRNA
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_026561
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 34091300 ~ 34091356 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGCAGACTGAGATCAGAGCTGTGTATTACTGCGCCAGAAAGAAATACCACAGTGAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040724-169 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000132692

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051677 lncRNA downstream 152479 33936453 ~ 33938821 (-) True XLOC_026512
TCONS_00051675 lncRNA downstream 155862 33922620 ~ 33935438 (-) False XLOC_026512
TCONS_00053065 lncRNA downstream 172105 33918566 ~ 33919195 (-) True XLOC_026511
TCONS_00051667 lncRNA downstream 400546 33681518 ~ 33690754 (-) True XLOC_026509
TCONS_00051659 lncRNA downstream 653568 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00053066 lncRNA upstream 48281 34139637 ~ 34141181 (-) True XLOC_026572
TCONS_00051762 lncRNA upstream 88451 34179807 ~ 34180432 (-) False XLOC_026573
TCONS_00051763 lncRNA upstream 88451 34179807 ~ 34180451 (-) True XLOC_026573
TCONS_00051771 lncRNA upstream 378798 34470154 ~ 34477363 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051773 lncRNA upstream 434586 34525942 ~ 34546406 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051743 mRNA downstream 844 34089983 ~ 34090456 (-) True XLOC_026560
TCONS_00051742 mRNA downstream 1990 34088852 ~ 34089310 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051741 mRNA downstream 3906 34086948 ~ 34087394 (-) True XLOC_026559
TCONS_00051739 mRNA downstream 5964 34084861 ~ 34085336 (-) True XLOC_026557
TCONS_00051737 mRNA downstream 6913 34081851 ~ 34084387 (-) False XLOC_026556
TCONS_00051745 mRNA upstream 1102 34092458 ~ 34092914 (-) True XLOC_026562
TCONS_00051746 mRNA upstream 3404 34094760 ~ 34095221 (-) True XLOC_026515
TCONS_00051747 mRNA upstream 4158 34095514 ~ 34103123 (-) False XLOC_026563
TCONS_00051748 mRNA upstream 5157 34096513 ~ 34096987 (-) True XLOC_026564
TCONS_00051749 mRNA upstream 6903 34098259 ~ 34098731 (-) True XLOC_026565
TCONS_00051740 other downstream 4817 34086041 ~ 34086483 (-) True XLOC_026558
TCONS_00051725 other downstream 26364 34063955 ~ 34064936 (-) True XLOC_026547
TCONS_00051722 other downstream 32583 34058679 ~ 34058717 (-) True XLOC_026544
TCONS_00051716 other downstream 42647 34048205 ~ 34048653 (-) True XLOC_026539
TCONS_00051715 other downstream 43684 34047179 ~ 34047616 (-) True XLOC_026538
TCONS_00051752 other upstream 11601 34102957 ~ 34103365 (-) True XLOC_026563
TCONS_00051772 other upstream 434586 34525942 ~ 34546399 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051781 other upstream 560954 34652310 ~ 34656737 (-) False XLOC_026581
TCONS_00051782 other upstream 561616 34652972 ~ 34654998 (-) False XLOC_026581
TCONS_00051787 other upstream 652223 34743579 ~ 34753541 (-) True XLOC_026582