RNA id: TCONS_00011274



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00011274
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.59
exon number 1
gene id XLOC_005670
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 438347 ~ 438462 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gCCACAGCctcatcaccctgcagcccaagagctgcgaatcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtgtctggattggagaccacatgggaacactaggctgCTGCtggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189254

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00013523 lncRNA upstream 169030 268042 ~ 269317 (+) True XLOC_005661
TCONS_00013522 lncRNA upstream 195728 242088 ~ 242619 (+) True XLOC_005659
TCONS_00013521 lncRNA upstream 228615 202760 ~ 209732 (+) True XLOC_005656
TCONS_00013375 lncRNA upstream 415172 20646 ~ 23175 (+) True XLOC_005653
TCONS_00013374 lncRNA upstream 417768 18808 ~ 20579 (+) True XLOC_005652
TCONS_00013524 lncRNA downstream 33086 471548 ~ 704248 (+) False XLOC_005671
TCONS_00013525 lncRNA downstream 33089 471551 ~ 704338 (+) True XLOC_005671
TCONS_00011279 lncRNA downstream 95996 534458 ~ 544116 (+) True XLOC_005674
TCONS_00013526 lncRNA downstream 115129 553591 ~ 560985 (+) True XLOC_005675
TCONS_00013529 lncRNA downstream 420595 859057 ~ 861896 (+) False XLOC_005685
TCONS_00011273 mRNA upstream 8204 421231 ~ 430143 (+) True XLOC_005669
TCONS_00011272 mRNA upstream 20719 416648 ~ 417628 (+) True XLOC_005668
TCONS_00011271 mRNA upstream 25730 411607 ~ 412617 (+) True XLOC_005667
TCONS_00011270 mRNA upstream 30702 406635 ~ 407645 (+) True XLOC_005666
TCONS_00011269 mRNA upstream 34234 403103 ~ 404113 (+) True XLOC_005665
TCONS_00011275 mRNA downstream 44449 482911 ~ 490569 (+) True XLOC_005672
TCONS_00011276 mRNA downstream 63768 502230 ~ 514843 (+) False XLOC_005673
TCONS_00011278 mRNA downstream 95991 534453 ~ 545653 (+) False XLOC_005674
TCONS_00011280 mRNA downstream 208238 646700 ~ 664472 (+) True XLOC_005676
TCONS_00011281 mRNA downstream 230715 669177 ~ 670746 (+) True XLOC_005677
TCONS_00011277 other downstream 63857 502319 ~ 511139 (+) True XLOC_005673
TCONS_00011289 other downstream 405681 844143 ~ 849426 (+) False XLOC_005684
TCONS_00011310 other downstream 1327045 1765507 ~ 1765622 (+) True XLOC_005701
TCONS_00011320 other downstream 1947951 2386413 ~ 2386533 (+) True XLOC_005710
TCONS_00011338 other downstream 2394630 2833092 ~ 2833207 (+) True XLOC_005718