RNA id: TCONS_00004324


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00004324
length 177
RNA type mRNA
GC content 0.47
exon number 2
gene id XLOC_002262
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 34236168 ~ 34236424 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GATGGTGAGGTCATCGGCATTAATACCATGAAAGTGACAGCAGGGATTTCCTTCGCTATTCCCACAGACAGAGTCCGTCTCTTCCTAGACCGATCTGTAGATAGAGTAAAGTCTTGGTTTGGAGAATCGGGATCGAAAAGGCGTTACATTGGAGTGATGATGTTGACTTTGACCCCC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193417

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00005917 lncRNA upstream 42862 34190542 ~ 34193306 (+) True XLOC_002261
TCONS_00005916 lncRNA upstream 177851 34057291 ~ 34058317 (+) False XLOC_002256
TCONS_00005725 lncRNA upstream 365156 33870189 ~ 33871012 (+) True XLOC_002252
TCONS_00005724 lncRNA upstream 868003 33363402 ~ 33368165 (+) True XLOC_002245
TCONS_00004293 lncRNA upstream 872060 33362166 ~ 33364108 (+) False XLOC_002245
TCONS_00005918 lncRNA downstream 2636 34239060 ~ 34239838 (+) True XLOC_002263
TCONS_00005919 lncRNA downstream 817887 35054311 ~ 35058561 (+) True XLOC_002269
TCONS_00004341 lncRNA downstream 916517 35152941 ~ 35156528 (+) False XLOC_002270
TCONS_00005920 lncRNA downstream 999924 35236348 ~ 35242028 (+) True XLOC_002271
TCONS_00004348 lncRNA downstream 1054807 35291231 ~ 35292231 (+) True XLOC_002274
TCONS_00004323 mRNA upstream 15927 34206616 ~ 34220241 (+) True XLOC_002260
TCONS_00004322 mRNA upstream 16042 34175476 ~ 34220126 (+) False XLOC_002260
TCONS_00004317 mRNA upstream 131677 34091763 ~ 34104491 (+) True XLOC_002256
TCONS_00004314 mRNA upstream 131685 34047352 ~ 34104483 (+) False XLOC_002256
TCONS_00004312 mRNA upstream 210043 34010494 ~ 34026125 (+) False XLOC_002254
TCONS_00004325 mRNA downstream 79295 34315719 ~ 34402535 (+) False XLOC_002264
TCONS_00004326 mRNA downstream 85068 34321492 ~ 34370206 (+) False XLOC_002264
TCONS_00004327 mRNA downstream 141273 34377697 ~ 34394824 (+) False XLOC_002264
TCONS_00004328 mRNA downstream 158030 34394454 ~ 34404768 (+) True XLOC_002264
TCONS_00004329 mRNA downstream 189832 34426256 ~ 34734995 (+) False XLOC_002265
TCONS_00004321 other upstream 49179 34175468 ~ 34186989 (+) False XLOC_002260
TCONS_00004320 other upstream 64743 34151286 ~ 34171425 (+) True XLOC_002259
TCONS_00004319 other upstream 88923 34124421 ~ 34147245 (+) True XLOC_002258
TCONS_00004318 other upstream 115867 34108541 ~ 34120301 (+) True XLOC_002257
TCONS_00004316 other upstream 149819 34067879 ~ 34086349 (+) False XLOC_002256
TCONS_00004333 other downstream 701124 34937548 ~ 34951865 (+) False XLOC_002266
TCONS_00004334 other downstream 713671 34950095 ~ 34951532 (+) False XLOC_002266
TCONS_00004335 other downstream 714632 34951056 ~ 34951532 (+) True XLOC_002266
TCONS_00004338 other downstream 766374 35002798 ~ 35009437 (+) False XLOC_002268
TCONS_00004339 other downstream 769471 35005895 ~ 35009096 (+) True XLOC_002268