RNA id: TCONS_00000583


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000583
length 514
RNA type mRNA
GC content 0.52
exon number 2
gene id XLOC_000339
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 29140884 ~ 29164911 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATTGAAGTACACTTCAGAGAGCTCACTTACTTCACAGTGTGTTCAGGTCAGTCCCACTGCCTTCTTTGTGTGCGTGGTCGGTGTTTTCTGAGCACGCACGCCGGCTTGCTCACCTTGGGGCTTTCGTAAACCTAACAAATTGGGGTTTCCAAGACACAGACCATGTCTGTAGGAGTGGAGTCCGGTTTCTCCAACGACGAAGTGCTCAACATACGTTACCCGCTTCACCGCGCATGCAGGGATGGAGATGTCGGCGCACTGTGCTCGCTGCTTCAGCGCTCAACCAACCAGGCAGACTTGGTTGCCGAAGACTCTTTTTACGGCTGGACCCCTATTCATTGGGCAGCACACTTCGGGAAGCTGGAGTGTGTTATGAGGCTGGTGCAGGTGGGATGTGAAGTGAACATACTGACGACCCGATTTGCCCAGACTCCAGCACACATTGCTGCATTTGGAGGACATCCAGAATGCCTTTTGTGGCTTATACACAGAGGAGCTGAAATAAACAGACAGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040426-700 Orthologous to human ANKRD10 (ankyrin repeat domain 10).

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000150133

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00000577 lncRNA upstream 69625 29068649 ~ 29071356 (+) False XLOC_000337
TCONS_00000576 lncRNA upstream 236346 28903770 ~ 28904635 (+) True XLOC_000336
TCONS_00003080 lncRNA upstream 667568 28472199 ~ 28473413 (+) True XLOC_000335
TCONS_00000568 lncRNA upstream 1104833 28031697 ~ 28036148 (+) False XLOC_000333
TCONS_00000585 lncRNA downstream 31697 29174195 ~ 29180648 (+) True XLOC_000340
TCONS_00000588 lncRNA downstream 35647 29178145 ~ 29179934 (+) False XLOC_000341
TCONS_00000587 lncRNA downstream 35647 29178145 ~ 29179934 (+) False XLOC_000341
TCONS_00000591 lncRNA downstream 41474 29183972 ~ 29185269 (+) True XLOC_000342
TCONS_00000595 lncRNA downstream 169029 29311527 ~ 29312559 (+) True XLOC_000346
TCONS_00000581 mRNA upstream 40058 29096881 ~ 29100923 (+) True XLOC_000338
TCONS_00000578 mRNA upstream 47419 29068654 ~ 29093562 (+) False XLOC_000337
TCONS_00000580 mRNA upstream 47982 29070661 ~ 29092999 (+) True XLOC_000337
TCONS_00000575 mRNA upstream 945714 28089703 ~ 28195267 (+) True XLOC_000334
TCONS_00000574 mRNA upstream 1093739 28031892 ~ 28047242 (+) True XLOC_000333
TCONS_00000584 mRNA downstream 19980 29162478 ~ 29164350 (+) True XLOC_000339
TCONS_00000586 mRNA downstream 35619 29178117 ~ 29179930 (+) False XLOC_000341
TCONS_00000589 mRNA downstream 35833 29178331 ~ 29179533 (+) True XLOC_000341
TCONS_00000590 mRNA downstream 41464 29183962 ~ 29202689 (+) False XLOC_000342
TCONS_00000592 mRNA downstream 69042 29211540 ~ 29228393 (+) True XLOC_000343
TCONS_00000579 other upstream 60645 29068662 ~ 29080336 (+) False XLOC_000337
TCONS_00000565 other upstream 1139044 27977370 ~ 28001937 (+) False XLOC_000332
TCONS_00000567 other upstream 1145370 27984393 ~ 27995611 (+) True XLOC_000332
TCONS_00000557 other upstream 1410001 27713349 ~ 27730980 (+) False XLOC_000329
TCONS_00000518 other upstream 3021357 26111385 ~ 26119624 (+) True XLOC_000317
TCONS_00000608 other downstream 689261 29831759 ~ 29860373 (+) False XLOC_000356
TCONS_00000617 other downstream 1023455 30165953 ~ 30166065 (+) True XLOC_000360
TCONS_00000618 other downstream 1084893 30227391 ~ 30227505 (+) True XLOC_000361
TCONS_00000628 other downstream 1813427 30955925 ~ 30965004 (+) True XLOC_000366
TCONS_00000632 other downstream 1914742 31057240 ~ 31063850 (+) True XLOC_000367

Expression Profile

//