RNA id: TCONS_00008738


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00008738
length 4812
lncRNA type inter_gene
GC content 0.34
exon number 2
gene id XLOC_003838
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 2976603 ~ 2982382 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00008443 lncRNA downstream 132720 2842098 ~ 2843883 (-) True XLOC_003837
TCONS_00008736 lncRNA downstream 216237 2756893 ~ 2760366 (-) True XLOC_003835
TCONS_00007363 lncRNA downstream 348466 2625032 ~ 2628137 (-) True XLOC_003833
TCONS_00008442 lncRNA downstream 528089 2446641 ~ 2448514 (-) True XLOC_003826
TCONS_00008735 lncRNA downstream 660390 2315496 ~ 2316213 (-) True XLOC_003825
TCONS_00007368 lncRNA upstream 322169 3304551 ~ 3308462 (-) True XLOC_003839
TCONS_00007372 lncRNA upstream 357917 3340299 ~ 3341687 (-) True XLOC_003841
TCONS_00007374 lncRNA upstream 368788 3351170 ~ 3366484 (-) False XLOC_003842
TCONS_00007377 lncRNA upstream 387973 3370355 ~ 3372027 (-) True XLOC_003842
TCONS_00008739 lncRNA upstream 402722 3385104 ~ 3494964 (-) False XLOC_003843
TCONS_00007365 mRNA downstream 137904 2829812 ~ 2838699 (-) False XLOC_003836
TCONS_00007366 mRNA downstream 139447 2832751 ~ 2837156 (-) True XLOC_003836
TCONS_00007364 mRNA downstream 276206 2691243 ~ 2700397 (-) True XLOC_003834
TCONS_00007362 mRNA downstream 343856 2616816 ~ 2632747 (-) False XLOC_003833
TCONS_00007361 mRNA downstream 382558 2571486 ~ 2594045 (-) True XLOC_003832
TCONS_00007367 mRNA upstream 318895 3301277 ~ 3308569 (-) False XLOC_003839
TCONS_00007369 mRNA upstream 338216 3320598 ~ 3334248 (-) False XLOC_003840
TCONS_00007370 mRNA upstream 338741 3321123 ~ 3334250 (-) True XLOC_003840
TCONS_00007371 mRNA upstream 354142 3336524 ~ 3343463 (-) False XLOC_003841
TCONS_00007373 mRNA upstream 363023 3345405 ~ 3366782 (-) False XLOC_003842
TCONS_00007330 other downstream 1888088 1069406 ~ 1088515 (-) False XLOC_003806
TCONS_00007326 other downstream 1996855 923795 ~ 979748 (-) True XLOC_003803
TCONS_00007304 other downstream 2516673 459815 ~ 459930 (-) True XLOC_003793
TCONS_00007296 other downstream 2624902 349113 ~ 351701 (-) True XLOC_003787
TCONS_00007400 other upstream 971341 3953723 ~ 3953837 (-) True XLOC_003853
TCONS_00007438 other upstream 3089578 6071960 ~ 6072066 (-) True XLOC_003881
TCONS_00007441 other upstream 3214894 6197276 ~ 6206589 (-) False XLOC_003884
TCONS_00007456 other upstream 3798326 6780708 ~ 6782076 (-) True XLOC_003894
TCONS_00007463 other upstream 3961918 6944300 ~ 6948018 (-) False XLOC_003898

Expression Profile

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