RNA id: TCONS_00000487



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000487
length 496
RNA type mRNA
GC content 0.46
exon number 2
gene id XLOC_000293
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 24365582 ~ 24367412 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GATCAACACAGCAGAATGCTTCCATTGGAGATCGTCCTCACATTGATGGCAAATAAAGGGTGCAAAGAGCCAGGGATCATCCAACTGCTGGACTGGAAGGTTTACCGGGATCATTTCATCATGATCTTCGAGTATCCTTCTCCATGTCAGGATTTGGAGGTTTTTATGAGGAATCAAGGTGGCAAAGTCAGTGAGAGTTTCGCAAGGCAAGTCATGACGCAGATTATTCAGGCTGCGCTCGTGTGCTGCCAGCGTGGTGTCTTTCACCGGGATATCAAACTCTCCAACCTTCTCATCAACACCGAGACATTTCAAGTCAAACTAATTGACTTTGGCTGCGGAGCCATTTTGAAGAAATCTTACTACAGGACCTTCAGTGGGACATTTTTGTACATTCCTCCTGAGTACATTTTTGAAGGGAAATACCATGCCAATCCTGCGACAGCATGGTCTCTGGGGATATTGCTATTCAGATTGGTGTGCGGAAGATATCCAT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000139913

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002831 lncRNA upstream 2420 24361993 ~ 24363690 (+) True XLOC_000292
TCONS_00000484 lncRNA upstream 8149 24355523 ~ 24357961 (+) False XLOC_000291
TCONS_00000485 lncRNA upstream 9238 24355542 ~ 24356872 (+) True XLOC_000291
TCONS_00000481 lncRNA upstream 22376 24337062 ~ 24343734 (+) False XLOC_000290
TCONS_00003071 lncRNA downstream 95404 24462460 ~ 24463305 (+) True XLOC_000297
TCONS_00002833 lncRNA downstream 229270 24596326 ~ 24599988 (+) False XLOC_000300
TCONS_00002832 lncRNA downstream 229270 24596326 ~ 24599988 (+) False XLOC_000300
TCONS_00002834 lncRNA downstream 229837 24596893 ~ 24599988 (+) False XLOC_000300
TCONS_00002835 lncRNA downstream 230620 24597676 ~ 24599665 (+) True XLOC_000300
TCONS_00000483 mRNA upstream 6457 24355515 ~ 24359653 (+) False XLOC_000291
TCONS_00000479 mRNA upstream 288011 24076243 ~ 24078099 (+) True XLOC_000286
TCONS_00000476 mRNA upstream 453322 23784905 ~ 23912788 (+) False XLOC_000284
TCONS_00000488 mRNA downstream 9338 24376394 ~ 24380533 (+) True XLOC_000294
TCONS_00000489 mRNA downstream 15595 24382651 ~ 24385979 (+) False XLOC_000295
TCONS_00000491 mRNA downstream 20603 24387659 ~ 24391673 (+) True XLOC_000296
TCONS_00000492 mRNA downstream 102257 24469313 ~ 24511625 (+) False XLOC_000298
TCONS_00000493 mRNA downstream 115350 24482406 ~ 24514673 (+) True XLOC_000298
TCONS_00000480 other upstream 251552 24114525 ~ 24114558 (+) True XLOC_000287
TCONS_00000478 other upstream 499145 23866878 ~ 23866965 (+) True XLOC_000285
TCONS_00000472 other upstream 614897 23751099 ~ 23751213 (+) True XLOC_000283
TCONS_00000467 other upstream 861007 23504334 ~ 23505103 (+) False XLOC_000281
TCONS_00000457 other upstream 1086408 23274922 ~ 23279702 (+) True XLOC_000276
TCONS_00000490 other downstream 15911 24382967 ~ 24384697 (+) True XLOC_000295
TCONS_00000495 other downstream 753033 25120089 ~ 25120205 (+) True XLOC_000301
TCONS_00000518 other downstream 1744329 26111385 ~ 26119624 (+) True XLOC_000317
TCONS_00000557 other downstream 3346293 27713349 ~ 27730980 (+) False XLOC_000329
TCONS_00000565 other downstream 3610314 27977370 ~ 28001937 (+) False XLOC_000332

Expression Profile


//