RNA id: TCONS_00000480



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000480
length 34
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_000287
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 24114525 ~ 24114558 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagc

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000158680

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00000466 lncRNA upstream 608007 23489111 ~ 23506518 (+) False XLOC_000281
TCONS_00000468 lncRNA upstream 608007 23505666 ~ 23506518 (+) True XLOC_000281
TCONS_00000462 lncRNA upstream 734315 23379008 ~ 23380210 (+) True XLOC_000278
TCONS_00003067 lncRNA upstream 1595771 22510734 ~ 22518754 (+) False XLOC_000269
TCONS_00002830 lncRNA downstream 3809 24118367 ~ 24119067 (+) True XLOC_000288
TCONS_00003069 lncRNA downstream 11822 24126380 ~ 24144170 (+) True XLOC_000289
TCONS_00003070 lncRNA downstream 222422 24336980 ~ 24337792 (+) False XLOC_000290
TCONS_00000481 lncRNA downstream 222504 24337062 ~ 24343734 (+) False XLOC_000290
TCONS_00000482 lncRNA downstream 223834 24338392 ~ 24343190 (+) True XLOC_000290
TCONS_00000479 mRNA upstream 36426 24076243 ~ 24078099 (+) True XLOC_000286
TCONS_00000477 mRNA upstream 201737 23784905 ~ 23912788 (+) False XLOC_000284
TCONS_00000476 mRNA upstream 201737 23784905 ~ 23912788 (+) False XLOC_000284
TCONS_00000475 mRNA upstream 201737 23784905 ~ 23912788 (+) False XLOC_000284
TCONS_00000474 mRNA upstream 201737 23784905 ~ 23912788 (+) True XLOC_000284
TCONS_00000483 mRNA downstream 240957 24355515 ~ 24359653 (+) False XLOC_000291
TCONS_00000486 mRNA downstream 251024 24365582 ~ 24367412 (+) False XLOC_000293
TCONS_00000487 mRNA downstream 251552 24366110 ~ 24367056 (+) True XLOC_000293
TCONS_00000488 mRNA downstream 261836 24376394 ~ 24380533 (+) True XLOC_000294
TCONS_00000489 mRNA downstream 268093 24382651 ~ 24385979 (+) False XLOC_000295
TCONS_00000478 other upstream 247560 23866878 ~ 23866965 (+) True XLOC_000285
TCONS_00000472 other upstream 363312 23751099 ~ 23751213 (+) True XLOC_000283
TCONS_00000467 other upstream 609422 23504334 ~ 23505103 (+) False XLOC_000281
TCONS_00000457 other upstream 834823 23274922 ~ 23279702 (+) True XLOC_000276
TCONS_00000444 other upstream 1593199 22521212 ~ 22521326 (+) True XLOC_000270
TCONS_00000490 other downstream 268409 24382967 ~ 24384697 (+) True XLOC_000295
TCONS_00000495 other downstream 1005531 25120089 ~ 25120205 (+) True XLOC_000301
TCONS_00000518 other downstream 1996827 26111385 ~ 26119624 (+) True XLOC_000317
TCONS_00000557 other downstream 3598791 27713349 ~ 27730980 (+) False XLOC_000329
TCONS_00000565 other downstream 3862812 27977370 ~ 28001937 (+) False XLOC_000332